Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms