Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms