Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd1Q02242 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms