Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms