Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms