Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp1Q00915 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms