Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms