Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbp4Q00724 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms