Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SeleQ00690 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms