Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pax8Q00288 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms