Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cry1P97784 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms