Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps45P97390 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps45P97390 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms