Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms