Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms