Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux2P70298 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux2P70298 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux2P70298 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux2P70298 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cux2P70298 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux2P70298 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux2P70298 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms