Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sycp3P70281 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms