Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms