Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcbP68404 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms