Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crabp1P62965 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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