Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms