Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarf2P59222 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms