Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Senp1P59110 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Senp1P59110 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms