Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms