Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5bP56480 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms