Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp5P56399 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms