Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtswP56203 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtswP56203 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtswP56203 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtswP56203 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtswP56203 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtswP56203 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtswP56203 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtswP56203 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtswP56203 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtswP56203 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtswP56203 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtswP56203 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtswP56203 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtswP56203 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtswP56203 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtswP56203 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtswP56203 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CtswP56203 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtswP56203 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtswP56203 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtswP56203 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtswP56203 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtswP56203 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms