Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtskP55097 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtskP55097 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtskP55097 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtskP55097 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtskP55097 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtskP55097 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtskP55097 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtskP55097 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
CtskP55097 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtskP55097 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtskP55097 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtskP55097 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtskP55097 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtskP55097 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtskP55097 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtskP55097 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtskP55097 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtskP55097 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtskP55097 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtskP55097 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtskP55097 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtskP55097 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtskP55097 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtskP55097 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CtskP55097 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtskP55097 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtskP55097 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CtskP55097 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtskP55097 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms