Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms