Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2e3P52483 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2e3P52483 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms