Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aff3P51827 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aff3P51827 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms