Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx3P50481 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms