Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms