Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LmnaP48678 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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