Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrprbP47758 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms