Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd1P40201 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd1P40201 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd1P40201 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd1P40201 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms