Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms