Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms