Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms