Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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