Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms