Protein–RNA interactions for Protein: P30275

Ckmt1, Creatine kinase U-type, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckmt1P30275 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckmt1P30275 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms