Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc1P29341 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms