Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vav1P27870 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms