Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms