Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkchP23298 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms