Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a2P20490 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a2P20490 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms