Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms