Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms