Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gata1P17679 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms