Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rag1P15919 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms